全县林业用地面积340.53万亩，森林面积301万亩， 森林覆盖率69.23%、森林蓄积1663.8万立方米。设立各类自然保护地8处，总面积7.23万公顷，占全县辖区面积24%。其中国家级自然保护地2处（四川米仓山国家级自然保护区、米仓山大峡谷国家级风景名胜区），省级保护地5处（四川汉王山东河湿地省级自然保护区、四川省旺苍大峡谷森林公园、鼓城山－七里峡省级风景名胜区、四川省鼓城山省级森林公园、米仓山省级自然与文化遗产地），市级自然保护地1处（松米山森林公园）。

旺苍县内脊椎动物种类丰富，其中鸟类 119 种、兽类 40 种、爬行动物 31 种、两栖动物 32 种、鱼类 70 种。国家 Ⅱ级保护动物 22 种，其中鸟类 14 种，兽类 7 种，两栖动物 1 种。国家Ⅱ级保护鸟类黑红腹角雉、红腹锦鸡、短耳鸮等；国家 Ⅱ级保护兽类猕猴、水獭、黄喉貂等；国家Ⅱ级保护两栖动物大鲵。